PROFILS EPIDEMIOLOGIQUES, MOLECULAIRES ET MUTATIONNELS DANS LE SYNDROME SEIN- OVAIRES

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 Abstract

Les progrès technologiques les plus récents permettent aujourd’hui de rechercher des mutations sur plusieurs gènes de façon simultanée. Ainsi, en une seule analyse, des données qui portent sur un ensemble de gènes susceptibles d’intervenir dans la prédisposition au cancer peuvent être obtenues. Ces nouvelles techniques (NGS, Next Generation Sequencing) de séquençage à haut débit permettent de tester l’ensemble des gènes susceptibles d’intervenir dans la prédisposition au cancer du sein [1, 2 , 3].L’analyse actuellement réalisée, dite en panels multigènes, est notamment étendue aux gènes impliqués dans la recombinaison homologue [4, 5], dont les gènes majeurs, BRCA1, BRCA2ou PALB2. Selon l’expertise conduite par Unicancer, une analyse de 13 gènes est recommandée [6], comprenant : BRCA 1, 2, PALB2, ATM, CDH1, EPCAM, HOXB13, MLH1,MSH2,  MSH6, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, TP53.Selon le gène concerné, le niveau de risque de cancer varie. Les dispositions de prise en charge préconisées pourront donc être modulées en fonction du gène muté et des progrès de nos connaissances, au fur et à mesure de l’expérience accumulée au niveau international. Il faut souligner l’importance conjointe et prédominante de l’histoire familiale selon les recommandations de la Haute autorité de santé de 2014.

 « De nos jours, toutes les définitions qu’on donne du cancer, toutes les descriptions que les auteurs nous tracent de cette cruelle maladie, se rapportent sinon exclusivement, du moins en grande partie, au cancer des mamelles. »

       Dictionnaire de PANCKOUCKE Charles Joseph,  rubrique « Cancer »  XIXe siècle

Corrélations Mutationnelles et Classification moléculaire dans les mutations constitutionnelles BRCA1/BRCA2/PALB2

Les fonctions normales des gènes de prédisposition au cancer du sein, BRCA1/2(ou autres), sont donc de participer aux mécanismes de réparation de l’ADN des cassures double brin par recombinaison homologue. Les cassures double-brin surviennent au cours de la réplication de l’ADN et la perte de la fonction suppresseur de tumeur de BRCA1et BRCA2semble essentielle dans la carcinogenèse du sein et de l’ovaire. Il n’est néanmoins pas compris pourquoi l’altération de ces gènes prédispose surtout aux cancers du sein et de l’ovaire. Et à ce jour environ 50% des cancers du sein survenant dans un contexte fortement évocateur d’une prédisposition héréditaire, restent inexpliqués c’est-à-dire sans mutation identifiée pouvant être responsable de la prédisposition.[7]

De nouvelles thérapies, les inhibiteurs des PARP (poly-ADP-ribose-polymérase-1) ciblent et inhibent les voies de réparation simple brin de l’ADN, voie complémentaire de réparation par recombinaison homologue. Dans les tumeurs ayant un défaut de réparation de l’ADN double brin du à une mutation germinale (héréditaire) ou somatique (tumorale) d’un des gènes de prédisposition, l’utilisation de ces traitements inhibiteurs des PARP entrainent également une impossibilité de réparer les cassures simple brin et donc une accumulation de mutations non compatibles avec la survie cellulaire aboutissant à l’apoptose des cellules tumorales. Il s’agit du principe de la léthalité synthétique [8, 9].

La mise en évidence d’une mutation des gènes BRCA1ou BRCA2fait actuellement partie des tests prédictifs de réponse aux inhibiteurs de PARP. Il faut noter que des mécanismes épigénétiques comme laméthylation de l’ADN contribuent également à l’altération des fonctions de BRCA1et 2. Dans le cancer de l’ovaire, la présence de mutation somatique de BRCA1/2est prédictive de l’efficacité du traitement.

L’utilisation des techniques de séquençage parallèle massif a permis la description du répertoire des mutations somatiques (c’est-à-dire survenant dans la tumeur) en fonction de la classe moléculaire de cancer du sein. Certains gènes de prédisposition au cancer peuvent ainsi être mutés et participer à la carcinogénèse en l’absence de mutation héréditaire. De façon plus récente, des associations de polymorphismes génétiques constitutionnels constituent des marqueurs de risque accru de cancer du sein [10] et sont utilisés dans le cadre d’essais cliniques pour ajuster le dépistage des cancers du sein. Il n’y a à priori que très peu de données concernant les spécificités morphologiques des cancers du sein qui leur sont associées.

Nos objectifs principaux à travers notre étude  sont les suivants :

·         Dresser le profil épidémiologique avec les principaux facteurs de risque modifiables et non modifiables chez 38  personnes mutées et atteintes de cancer précoce du sein /ovaire

·         Etablir les corrélations Moléculaires et Mutationnelle

·         Plaidoyer pour un dépistage adapté aux spécificités Algérienne.

·         Mise sur le marché des ANTI PARP

·         La prévention primaire et secondaire des principaux facteurs de risque

Matériel et Méthode

Notre étude est descriptive, observationnelle, prospective: 38 patients, tous « Cas Index » ont été prélevés au niveau de l’unité de dépistage du service de chirurgie « B » Sénologie &Pelvis  du Centre de lutte contre le cancer de Sidi Bel Abbes ALGERIE durant la période s’étendant de Janvier 2021- Janvier 2022.Il s’agissait de 36 Femmes et 02 Hommes, l’âge moyen a été de 38 ans avec des extrêmes de 18 -42 ans. Les dossiers médicaux et les fichiers électroniques  contenant les informations cliniques et sociodémographiques détaillées ont été obtenus dans notre banque de données au sein même de notre établissement spécialisé dans la lutte contre le cancer.

Le caractère Régional de notre établissement nous a permis de regrouper six wilayas de l’Ouest Algérien. Tous nos patients ont suivi le même protocole standardisé, à savoir :

1er entretien : Informatif, qui permet de :

v  Estimer la probabilité de prédisposition héréditaire en se basant sur :

·         L’Identification des Facteurs de Risque Modifiables et Non Modifiables  et rapportés sur une Fiche Technique de collecte des données

·          L’histoire familiale, qui est illustrée par l’arbre généalogique sur au moins trois générations, en notant tous les cas de cancer et les âges de leur survenue dans la famille

Le calcul du risque de prédisposition héréditaire de cancer du sein/ovaire a été fait  par l’onco-généticien du laboratoire  chez les patients qui présentent un ou plusieurs des signes évocateurs suivants [11,12] :

 1-Cancer du sein < 35 ans ;

2-Cancer du sein médullaire, cancer du sein triple négatif < 51 ans ;

3-Cancer du sein chez l’homme, quel que soit l’âge ;

4-Cancer de l’ovaire et cancer du sein chez une même patiente, quel que soit l’âge de survenue ;

5-Cancer de l’ovaire < 71 ans (hors mucineux, borderline, tumeurs germinales).

Le calcul du risque tumoral doit tenir compte des critères individuels déjà évoqués et des critères familiaux suivants :

1-Cancer du sein diagnostiqué avant 35 ans ;

2-Cancer des ovaires épithéliaux séreux à tout âge ;

3-Cancer du sein bilatéral chez la même femme ;

4-Cancer du sein et cancer de l’ovaire chez la même femme ou dans la même famille ;

5- Nombreux cancers du sein d’un même côté de la famille (deux parents)

6-Cancer du sein chez l’homme ;

7-Ethnicité juive ashkénaze/Islandaise.[13]

v  Identifier les différents types histologiques des carcinomes di sein et de l’Ovaire.

v  Etablir de manière individuelle les profils moléculaires de chaque tumeur en analysant les Récepteurs Hormonaux et le HER2

v  L’analyse moléculaire BRCA1/2, PALB 2 a été est indiquée, si la probabilité de prédisposition héréditaire est estimée ≥ 25%, ce qui équivaut à un taux de détection d’une mutation d’environ 10 à 15%.

v  En 2004, l’expertise collective INSERM a établi un score appelé score Eisinger, qui en additionnant les points des personnes atteintes de cancer du sein et/ou de l’ovaire, dans la même branche parentale, sélectionne les personnes qui devraient bénéficier d’un test BRCA1/2 (214)[14]:

Score Eisinger 2004 [15]:

• Cancer du sein chez une femme avant 30 ans : 4.

• Cancer du sein chez une femme entre 30 et 39 ans : 3.

• Cancer du sein chez une femme entre 40 et 49 ans : 2.

• Cancer du sein chez une femme entre 50 et 70 ans : 1.

• Cancer du sein chez un homme : 4.

• Cancer de l’ovaire : 3. (exception des cancers de l’ovaire bordeline ou mucineux).

Additionnez chaque cas de la même branche parentale :

A/ ≥ 5 : excellente indication,

B/ 4 ou 3 : indication possible,

C/2 ou 1 : utilité médicale faible.

2éme entretien :

 Consentement et prélèvement sanguin

Avant la prise de sang, le cas index doit être informé des limites et avantages du test et de la durée d’attente du résultat.

3ème entretien :

Rendu des résultats et élaboration d’un parcours de soins personnalisé pour les cas Index,  pour les Apparentés et pour les populations dites « à risques »

Retrouvez tous les détails relatifs à la consultation d’oncogénétique avec nos critères de sélection et nos calculs de risque sur notre dernier ouvrage  paru aux EDITIONS UNIVERSITAIRES EUROPEENNES : Mutations BRCA1 BRCA2 PALB2 Dans le syndrome Sein/ Ovaires, notre série, ISBN : 978-620-3-45977-7.

Aspects Technique et Protocole de séquençage

Extraction d’ARN :

Kit : GF-1 Blood Total RNA Extraction Kit (Vivantis)RT-qPCR:

Kit: SOLIScript® 1-step SolisGreen® Kit (Solis Biodyne).

PrimersSéquences
PALB2-FTGGGTGTGATGCTGTACTGTCTT
PALB2-rGGGCAGTACACTGACCGAGA
BRCA1-FCCCATTTTCCTCCCGCA
BRCA1-RGGACCTTGGTGGTTTCTTCCA
BRCA2-FAAGCATTGGAGGAATATCGTAGG
BRCA2-RCAGGTTCAGAATTATAGGGTGGAG
ACTB-FAAGATATTGCTCCCTCCTGAGC
ACTB-RCATACTCCTGCTTGCTGATCCA

Tableau 1 Listing des Amorces

Protocole:

40x One-step SOLIScript®Mix 0.5 μl 1x,5x One-step SolisGreen®Mix 4 μl 1xForward Primer (10 μM)2 0.8 μl 400 nMReverse Primer (10 μM)2 0.8 μl 400 nMTemplate RNA2 Variable 1 pg–1 μg(total RNA)Nuclease-free water up to 20 μl.Total reaction volume 20 μl

Tableau 2 :  Delta Ct (dCt)= Ct gène – Ct contrôle endogène,Delta Delta Ct (ddCt) = ΔCt échantillon1 – ΔCtcalibrateur, RQ = Relative quantification = 2-ΔΔCt

La taille tumorale moyenne est de 3,6 (ET 2,6) cm, avec 30 % des tumeurs ayant une taille très importante « T3 ».

Répartition Histologique tumorale

Tableau 6 Grading system et tranche d’age.

Grade SCARFF BLOOM RICHARDSON

La proportion des grades SBR  II et III est élevée, particulièrement pour les patientes de 25-30 ans chez lesquelles le pourcentage est estimé à 56 % pour SBR II et 29 % pour SBR  III. La proportion des tumeurs grade SBR I augmente avec l’âge ; en revanche l’inverse se produit avec les tumeurs grade SBR III présent chez 100% des patientes de moins de 25 ans

Résultats Analytiques génétiques mutationnels

GLS IDCLCC IDdCt BRCA1dCt PALB2dCt BRCA2R BRCA1R PALB2R BRCA2
110 20024,8522,197,484,047E+122,5936E+1385,0358921
210 204-3,01-3,51-3,4816612,7121475801,4030,04268876
310 046-2,9816,7815,2216961,78056,0999E+1118179,1862
410 026-22,99-8,89-10,570,0160642811425,74010,00031334
510 2037,0820,6415,2818106445,28,8573E+1218951,1792
610 118
710 1994,527,82-21,223070410,2512248857131,95E-07
810 119-4,07-0,87-11,417967,989332965820,80,00017504
910 209-36,85-3,95-9,731,0804E-06350729,6810,00056089
1010 12428,95332,41328,6836,9544E+133,0997E+16205277462
1110 03813,615,5814,1416732431942592915598599,27907
1210 0844,7113,150,583502612,64,927E+100,7120251
139 810
1410 069
159 8788,95-0,624,566184956,43526975,210,7778686
179 805
1810 24128,3829,9416,244,6749E+135,5831E+1536865,9164
1910 03112,3914,36-14,647182943871,1398E+111,8656E-05
2010 11527,2829,4922,542,1809E+134,0871E+152904785,09
2110 24717,621,3218,222,6587E+101,4191E+13145433,49
2210 29529,4930,219,331,0091E+146,6857E+15313911,858
2310 430-2,4728,4417,0724154,42691,9739E+1565536
249 819
258 210
2610 38620,2611,3821,111,6804E+111,4446E+101078055,48
2710 05627,0827,2132,171,8986E+138,4153E+142301615985
2810 794
2910 110
3010 23531,4231,611,193,8451E+141,7766E+161,08673486
3110 12529,4131,1211,889,5463E+131,265E+161795,28852
3210 251
3310 257
3410 233
3510 21311,1415,75-13,823020055872,9872E+113,2935E-05
3610 06529,9131,3517,771,35E+141,4836E+16106463,546
3710 057-8,0814,48-4,68494,55941,2387E+110,01858136
3810 240-0,0827,616,25126607,2071,1027E+1537122,3392
3910 02610,6525,2128,082150355582,1038E+14135151286

Case en vert: sous expression

Case en rouge: sur expression

Case vide: PCR à refaire

Corrélation étude immuno-histochimique et statuts mutationnels:

CodeBRCA1PALB2BRCA2IMMUNO/HISTO
1/ 10200+++++++++++TNG
2/ 10204+++++++– – –RH+/H2R2+++
3/ 10026–+++++++++– –RH+/HER2++++
4/ 10046++++++++++++++++++++TNG
5/ 10203++++++++++++++++++++TNG
6/ 10118++++++– –++++++++RH+/HER2-
7/ 10199++++++++++++++–TNG
8/ 10119 bilat+++++++++++++–TNG/RH+/HER2-
9/ 10209–++++++–RH+/HER2++++
10/ 10124++++++++++++++++++TNG
11/ 10039+++++++++++++++++++RH+/HER2++++
12/ 10084 Homme+++++++++++–RH+/HER2++++
13/ 9810/Homme/
KC Prostate++++++++++++++++RH+/HER2-
14/ 10069+++++++++++++++++TNG
15/ 9878++++++++++++++++RH+/HER2-
16/ 9805
17/ 10241+++++++++++++++++RH+/HER++++
18/ 10031+++++++++++–RH+/HER2++++
19/ 10115+ KC OVAIRE+++++++++++++++++RH+/HER2+++
20/ 10247 bilat++++++++++++–RH+/HER2+++/HER2-
21/ 10295+ KC Ovaire++++++++++++++++RH+/HER2+++
22/ 10430++++++++++++++++TNG
23/ 9819+++++++++++++++++RH+/HER2++++
24/ 8210
25/ 10386++++++++++++++++RH+/HER2++++
26/ 10056+++++++++++++++++TNG
27/ 10794++++++++++++–TNG
28/ 10110 bilat+++++++++++++–TNG/TNG
29/ 10235 bilat++++++++++++++–TNG/RH+/HER2+++
30/ 10125+++++++++++++++++++RH+/HER2-
31/ 10251+++++++++++++++++TNG
32/ 10257
33/ 10233
34/ 10213++++++++++++–RH+/HER2-
35/ 10065+++++++++++++++++RH+/HER2+++
36/ 10057+++++++++++–RH+/HER2+++
37/ 10240+++++++++++++++++TNG
38/ 10000+ KC OVAIRE+++++++++++++++++++++RH+/HER2+++

Tableau 4 Corrélation statut moléculaire et mutations génétiques

Corrélation immuno-histochimie, age et taille tumorale

Statut RE/RP/HER2%Tranche d’âgeTaille tumorale
RE+RP+HER2+36.826-30T3
RE-RP-HER2-28.9418-25T2-T3
RE+RP+HER2-13.1531-42T2-T3
RE+RP-HER2+0
RE-RP+HER2-0
RE-RP+HER2+0
RE-RP-HER2+0
RE+RP-HER2-0
RE-RP-HER2- / RE-RP-HER2-
(localisation bilatérale seins)531-42T2-T3
RE-RP-HER2- / RE+RP+HER2+
(localisation bilatérale seins)526-30T2-T3
RE+RP+HER2+ / RE+RP+HER2-
(localisation bilatérale seins)531-42T2-T3
RE-RP-HER2- / RE+RP+HER2-
(localisation bilatérale seins)531-42T2-T3

Tableau 5 corrélation immuno-histochimie, age et taille tumorale

RE : Récepteur œstrogène

RP : Récepteur progestérone

HER2 : Récepteur facteur de croissance épidermique humain

Corrélations mutations/ Immuno-histochimie et Index de Prolifération ki67

CodeBRCA1PALB2BRCA2IMMUNO/HISTO/Ki 67
1/ 10200+++++++++++TNG/ : 50%
2/ 10204+++++++– – –RH+/H2R2+++ 30%
3/ 10026–+++++++++– –RH+/HER2++++ 45%
4/ 10046++++++++++++++++++++TNG 35%
5/ 10203++++++++++++++++++++TNG 45%
6/ 10118++++++– – ++++++++RH+/HER2- 10%
7/ 10199++++++++++++++–TNG 35%
8/ 10119 bilat+++++++++++++–TNG/RH+/HER2- 25%
9/ 10209–++++++–RH+/HER2++++ 20%
10/ 10124++++++++++++++++++TNG 45%
11/ 10039+++++++++++++++++++RH+/HER2++++ 80%
12/ 10084 Homme+++++++++++–RH+/HER2++++30%
13/ 9810/Homme/ KC Prostate++++++++++++++++RH+/HER2-14%
14/ 10069+++++++++++++++++TNG 37%
15/ 9878++++++++++++++++RH+/HER2- 16%
16/ 9805
17/ 10241+++++++++++++++++RH+/HER++++ 35%
18/ 10031+++++++++++–RH+/HER2++++ 55%
19/ 10115+ KC OVAIRE+++++++++++++++++RH+/HER2+++20%
20/ 10247 bilat++++++++++++–RH+/HER2+++/HER2- 35%
21/ 10295+ KC Ovaire++++++++++++++++RH+/HER2+++40%
22/ 10430++++++++++++++++TNG 15%
23/ 9819+++++++++++++++++RH+/HER2++++ 35%
24/ 8210
25/ 10386++++++++++++++++RH+/HER2++++30%
26/ 10056+++++++++++++++++TNG 25%
27/ 10794++++++++++++–TNG 45%
28/ 10110 bilat+++++++++++++–TNG/TNG 25%
29/ 10235 bilat++++++++++++++–TNG/RH+/HER2+++50%
30/ 10125+++++++++++++++++++RH+/HER2- 10%
31/ 10251+++++++++++++++++TNG 20%
32/ 10257
33/ 10233
34/ 10213++++++++++++–RH+/HER2- 5%
35/ 10065+++++++++++++++++RH+/HER2+++ 55%
36/ 10057+++++++++++–RH+/HER2+++ 45%
37/ 10240+++++++++++++++++TNG 45%
38/ 10000+ KC OVAIRE+++++++++++++++++++++RH+/HER2+++ 16%

Corrélations mutations/ Immuno-histochimie/ Ki67

Âge : 25 – 30 : 56%   22 Patientes

30- 42 :   29%    11Patientes

18-25 :   15% ;    5Patientes

79, 41%,  N= 27/34 ont un Ki 67 ≥ 20%

Chez les hommes :

  • Un cas de cancer du sein + un cancer de la prostate synchrone : RH+/HER2-, positif aux 3 gènes (BRCA1, BRCA2, PALB2).
  • Un cas de cancer du sein RH+/HER2+, positif aux 2 gènes BRCA1, PALB2, négatif BRCA2.

Chez les femmes :

  • Trois associations sein+ovaires RH+/HER2+, positive aux 3 gènes. (BRCA1, BRCA2, PALB2).

Les 4 cases Vides font l’objet d’un élargissement de Panel (en cours)

CONCLUSION

Le  profil  épidémiologique  du  cancer  est  inquiétant dominé par des formes précoces, agressives, transmissibles et invasives d’emblée.

Ces  résultats  peuvent  être  réduits  significativement  par l’application  généralisé  de  programmes  de  lutte  contre  le cancer  incluant  la  prévention  primaire  et  secondaire ainsi que l’amélioration  des  connaissances  des  femmes  concernant les  facteurs  de  risques  tel  que  :  la  présence  d’un  terrain génétiques  favorable,  l’âge  précoce  des  premières  menstruations,  la  ménopause  tardive,  la  densité  mammaire, les  maladies  bénignes  du  sein et celles à potentiel malin.

Pour  obtenir  une  réduction  des  facteurs  de  risques  on peut  faire  les  recommandations  suivantes  :

•  Pour  les  médecins,  des  prescriptions  plus  modérées de  traitements  hormonaux  et  d’irradiations  thoraciques inutiles  (excès  de  mammographies  en  particulier)  sont susceptible  de  diminuer  le  risque  de  cancer  ;

•  Pour  les  femmes,  une  modification  de  la  vie  génitale  privilégiant  une  première  grossesse  précoce  avant  l’âge  de 30  ans,  un  allaitement  au  sein  de  plusieurs  mois,  une bonne  hygiène  alimentaire  (choix  d’aliment  de  bonne qualité  nutritionnelle),  la  limitation  au  maximum  de  la consommation  d’alcool,  de  l’obésité,  le  maintien  d’un rythme  de  vie  actif,  tout  en  évitant  l’exposition  au  tabagisme  actif  ou  passif  ;  l’éloignement  au  maximum  des polluants  environnementaux  et  le  maintien  d’un  bon rythme  circadien  devraient  avoir  une  action  bénéfique  sur le  risque  du  cancer  du  sein .

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